ଅନୁସନ୍ଧାନ

MAMP-ପ୍ରୋତ୍ସାହିତ ପ୍ରତିରକ୍ଷା ପ୍ରତିକ୍ରିୟାର ଶକ୍ତି ଏବଂ ଜ୍ୱାଳାରେ ଲକ୍ଷ୍ୟ ପତ୍ର ଦାଗ ପ୍ରତିରୋଧର ଜିନୋମ୍-ୱାଇଡ୍ ଆସୋସିଏସନ୍ ବିଶ୍ଳେଷଣ।

ଉଦ୍ଭିଦ ଏବଂ ରୋଗ ସୃଷ୍ଟିକାରୀ ସାମଗ୍ରୀ

ଇଲିନୋଇସ୍ ବିଶ୍ୱବିଦ୍ୟାଳୟ (ବର୍ତ୍ତମାନ UC ଡେଭିସ୍‌ରେ) ରେ ଡକ୍ଟର ପ୍ୟାଟ୍ ବ୍ରାଉନ୍‌ଙ୍କ ଦ୍ୱାରା ସୋର୍ଘମ୍ ରୂପାନ୍ତର ଜନସଂଖ୍ୟା (SCP) ନାମରେ ଜଣାଶୁଣା ଏକ ସୋର୍ଘମ୍ ଆସୋସିଏସନ୍ ମ୍ୟାପିଂ ଜନସଂଖ୍ୟା ପ୍ରଦାନ କରାଯାଇଥିଲା। ଏହା ପୂର୍ବରୁ ବର୍ଣ୍ଣନା କରାଯାଇଛି ଏବଂ ଏହା ଯୁକ୍ତରାଷ୍ଟ୍ର ପରିବେଶରେ ଉଦ୍ଭିଦଗୁଡ଼ିକର ବୃଦ୍ଧି ଏବଂ ବିକାଶକୁ ସହଜ କରିବା ପାଇଁ ଫଟୋପିରିଅଡ୍-ଅସମ୍ବେଦନଶୀଳତା ଏବଂ ଛୋଟ ଆକାରରେ ରୂପାନ୍ତରିତ ବିବିଧ ରେଖାଗୁଡ଼ିକର ଏକ ସଂଗ୍ରହ। ଏହି ଅଧ୍ୟୟନରେ ଏହି ଜନସଂଖ୍ୟାରୁ 510 ରେଖା ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇଥିଲା ଯଦିଓ ଖରାପ ଅଙ୍କୁରୀକରଣ ଏବଂ ଅନ୍ୟାନ୍ୟ ଗୁଣବତ୍ତା ନିୟନ୍ତ୍ରଣ ସମସ୍ୟା ଯୋଗୁଁ, ସମସ୍ତ ରେଖା ତିନୋଟି ଗୁଣର ବିଶ୍ଳେଷଣରେ ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇ ନଥିଲା। ଶେଷରେ 345 ରେଖାରୁ ତଥ୍ୟ ଚିଟିନ୍ ପ୍ରତିକ୍ରିୟାର ବିଶ୍ଳେଷଣ ପାଇଁ, flg22 ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ପାଇଁ 472 ରେଖା ଏବଂ TLS ପ୍ରତିରୋଧ ପାଇଁ 456 ରେଖା ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇଥିଲା।ବି. କୁକେଇଆର୍କାନସାସ ବିଶ୍ୱବିଦ୍ୟାଳୟର ଡକ୍ଟର ବର୍ଟ ବ୍ଲୁହମଙ୍କଠାରୁ LSLP18 ଷ୍ଟ୍ରେନ ପ୍ରାପ୍ତ ହୋଇଥିଲା।

MAMP ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ମାପ

ଏହି ଅଧ୍ୟୟନରେ ଦୁଇଟି ଭିନ୍ନ MAMP ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇଥିଲା flg22, (Genscript catalog# RP19986), ଏବଂ ଚିଟିନ୍। ଗ୍ରୀନହାଉସ୍‌ରେ ମାଟିରେ ପୂର୍ଣ୍ଣ ଫ୍ଲାଟ୍ (33% ସନସାଇନ୍ ରେଡି-ଆର୍ଥ ପ୍ରୋ ଗ୍ରୋଇଂ ମିକ୍ସ) ଉପରେ ରଖାଯାଇଥିବା ଇନସର୍ଟରେ ସୋର୍ଘମ୍ ଗଛ ଚାଷ କରାଯାଇଥିଲା। ସଂଗ୍ରହ ଦିନ ଅତିରିକ୍ତ ପତ୍ର ଆର୍ଦ୍ରତା ଏଡାଇବା ପାଇଁ ନମୁନା ସଂଗ୍ରହର ପୂର୍ବ ଦିନ ଗଛଗୁଡ଼ିକୁ ପାଣି ଦିଆଯାଇଥିଲା।

ଧାଡ଼ିଗୁଡ଼ିକୁ ଅନିୟମିତ କରାଯାଇଥିଲା ଏବଂ ଲଜିଷ୍ଟିକ୍ କାରଣରୁ, 60 ଧାଡ଼ିର ବ୍ୟାଚ୍‌ରେ ରୋପଣ କରାଯାଇଥିଲା। ପ୍ରତ୍ୟେକ ଧାଡ଼ି ପାଇଁ, ପ୍ରତି ଧାଡ଼ିରେ ଦୁଇଟି ବିହନ ସହିତ ତିନୋଟି 'ପାତ୍ର' ରୋପଣ କରାଯାଇଥିଲା। ପୂର୍ବ ବ୍ୟାଚ୍ ପ୍ରକ୍ରିୟାକରଣ ହେବା ମାତ୍ରେ ପରବର୍ତ୍ତୀ ବ୍ୟାଚ୍‌ଗୁଡ଼ିକୁ ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ଜନସଂଖ୍ୟା ମୂଲ୍ୟାଙ୍କନ ହେବା ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ରୋପଣ କରାଯାଇଥିଲା। ଦୁଇଟି MAMP ପାଇଁ ଦୁଇଟି ପରୀକ୍ଷାମୂଳକ ରନ୍ କରାଯାଇଥିଲା ଯେଉଁଥିରେ ପ୍ରତ୍ୟେକ ଦୁଇଟି ରନ୍‌ରେ ପୁନଃ-ନିୟମିତ ଜିନୋଟାଇପ୍ କରାଯାଇଥିଲା।

ପୂର୍ବରୁ ବର୍ଣ୍ଣିତ ଅନୁସାରେ ROS ପରୀକ୍ଷା କରାଯାଇଥିଲା। ସଂକ୍ଷେପରେ, ପ୍ରତ୍ୟେକ ଧାଡି ପାଇଁ, 3ଟି ଭିନ୍ନ ପାତ୍ରରେ ଛଅଟି ବିହନ ଲଗାଯାଇଥିଲା। ଫଳସ୍ୱରୂପ ଚାରା ମଧ୍ୟରୁ, ସମାନତା ଆଧାରରେ ତିନୋଟିକୁ ଚୟନ କରାଯାଇଥିଲା। ଯେଉଁ ଚାରାଗୁଡ଼ିକ ଅସ୍ୱାଭାବିକ ଦେଖାଯାଉଥିଲା କିମ୍ବା ଅଧିକାଂଶ ଅପେକ୍ଷା ଯଥେଷ୍ଟ ଉଚ୍ଚ କିମ୍ବା ଛୋଟ ଥିଲା, ସେଗୁଡ଼ିକୁ ବ୍ୟବହାର କରାଯାଇ ନଥିଲା। ତିନୋଟି ଭିନ୍ନ 15-ଦିନ ପୁରୁଣା ସୋର୍ଘମ୍ ଗଛର ଚତୁର୍ଥ ପତ୍ରର ପ୍ରଶସ୍ତ ଅଂଶରୁ 3 ମିମି ବ୍ୟାସର ଚାରୋଟି ପତ୍ର ଡିସ୍କ କାଟି ଦିଆଯାଇଥିଲା। ଦୁଇଟି ଗଛରୁ ପ୍ରତି ପତ୍ରରେ ଗୋଟିଏ ଡିସ୍କ ଏବଂ ଗୋଟିଏ ଗଛରୁ ଦୁଇଟି ଡିସ୍କ, ଦ୍ୱିତୀୟ ଡିସ୍କ ଜଳ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ ହୋଇଥିଲା (ନିମ୍ନରେ ଦେଖନ୍ତୁ)। ଡିସ୍କଗୁଡ଼ିକୁ ଏକ କଳା 96-କୂପ ପ୍ଲେଟରେ 50 μl H20 ଉପରେ ପୃଥକ ଭାବରେ ଭାସମାନ କରାଯାଇଥିଲା, ଆଲୋକର ସଂସ୍ପର୍ଶକୁ ଏଡାଇବା ପାଇଁ ଏକ ଆଲୁମିନିୟମ୍ ସିଲ୍ ସହିତ ସିଲ୍ କରାଯାଇଥିଲା, ଏବଂ ରାତାରାତି କୋଠରୀ ତାପମାତ୍ରାରେ ରଖାଯାଇଥିଲା। ପରଦିନ ସକାଳେ 2 mg/ml କେମିଲୁମିନେସେଣ୍ଟ ପ୍ରୋବ୍ L-012 (ୱାକୋ, କ୍ୟାଟାଲଗ୍ # 120-04891), 2 mg/ml ହର୍ସରାଡିଶ୍ ପେରୋକ୍ସିଡେଜ୍ (ଟାଇପ୍ VI-A, ସିଗମା-ଆଲଡ୍ରିଚ୍, କ୍ୟାଟାଲଗ୍ # P6782), ଏବଂ 100 mg/ml ଚିଟିନ୍ କିମ୍ବା Flg22 ର 2 μM ବ୍ୟବହାର କରି ଏକ ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ଦ୍ରବଣ ପ୍ରସ୍ତୁତ କରାଯାଇଥିଲା। ଚାରୋଟି କୂପ ମଧ୍ୟରୁ ତିନୋଟିରେ ଏହି ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ଦ୍ରବଣର 50 μl ଯୋଡା ଯାଇଥିଲା। ଚତୁର୍ଥ କୂପଟି ଏକ ମକ୍ କଣ୍ଟ୍ରୋଲ୍ ଥିଲା, ଯେଉଁଥିରେ MAMP ବାଦ ଦେଇ ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ଦ୍ରବଣ ଯୋଡା ଯାଇଥିଲା। ପ୍ରତ୍ୟେକ ପ୍ଲେଟରେ କେବଳ ପାଣି ଥିବା ଚାରୋଟି ଖାଲି କୂପ ମଧ୍ୟ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ କରାଯାଇଥିଲା।

ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ଦ୍ରବଣ ଯୋଡିବା ପରେ, ପ୍ରତି 2 ମିନିଟ୍ ରେ SynergyTM 2 ମଲ୍ଟି-ଡିଟେକ୍ସନ୍ ମାଇକ୍ରୋପ୍ଲେଟ୍ ରିଡର (BioTek) ବ୍ୟବହାର କରି 1 ଘଣ୍ଟା ପାଇଁ ଲ୍ୟୁମିନେସେନ୍ସ ମାପ କରାଯାଇଥିଲା। ଏହି 1 ଘଣ୍ଟା ମଧ୍ୟରେ ପ୍ଲେଟ୍ ରିଡର ପ୍ରତି 2 ମିନିଟ୍ ରେ ଲ୍ୟୁମିନେସେନ୍ସ ମାପ ନେଇଥାଏ। ପ୍ରତ୍ୟେକ କୂପର ମୂଲ୍ୟ ଦେବା ପାଇଁ ସମସ୍ତ 31 ପାଠର ସମଷ୍ଟି ଗଣନା କରାଯାଇଥିଲା। ପ୍ରତ୍ୟେକ ଜିନୋଟାଇପ୍ ପାଇଁ MAMP ପ୍ରତିକ୍ରିୟା ପାଇଁ ଆନୁମାନିକ ମୂଲ୍ୟ (ତିନୋଟି ପରୀକ୍ଷଣାତ୍ମକ କୂପର ହାରାହାରି ଲ୍ୟୁମିନେସେନ୍ସ ମୂଲ୍ୟ - ମକ୍ କୂପ ମୂଲ୍ୟ) - ହାରାହାରି ଖାଲି କୂପ ମୂଲ୍ୟ ବିଯୁକ୍ତ ଭାବରେ ଗଣନା କରାଯାଇଥିଲା। ଖାଲି କୂପ ମୂଲ୍ୟ ସ୍ଥିର ଭାବରେ ଶୂନ୍ୟର ନିକଟତର ଥିଲା।

ର ପତ୍ର ଡିସ୍କନିକୋଟିଆନା ବେନ୍ଥାମିଆନାଗୁଣବତ୍ତା ନିୟନ୍ତ୍ରଣ ଉଦ୍ଦେଶ୍ୟରେ ପ୍ରତ୍ୟେକ 96-କୂପ ପ୍ଲେଟରେ ନିୟନ୍ତ୍ରଣ ଭାବରେ ଗୋଟିଏ ଉଚ୍ଚ ପ୍ରତିକ୍ରିୟାଶୀଳ ସୋର୍ଘମ୍ ଲାଇନ୍ (SC0003), ଏବଂ ଗୋଟିଏ ନିମ୍ନ ପ୍ରତିକ୍ରିୟାଶୀଳ ସୋର୍ଘମ୍ ଲାଇନ୍ (PI 6069) ମଧ୍ୟ ଅନ୍ତର୍ଭୁକ୍ତ କରାଯାଇଥିଲା।

ବି. କୁକେଇଇନୋକୁଲମ୍ ପ୍ରସ୍ତୁତି ଏବଂ ଇନୋକୁଲେସନ୍

ବି. କୁକେଇପୂର୍ବରୁ ବର୍ଣ୍ଣିତ ପରି ଇନୋକୁଲମ୍ ପ୍ରସ୍ତୁତ କରାଯାଇଥିଲା। ସଂକ୍ଷେପରେ, ଜ୍ୱାଳା ଦାନାଗୁଡ଼ିକୁ ତିନି ଦିନ ପାଇଁ ପାଣିରେ ବୁଡ଼ାଇ, ଧୋଇ, 1 ଲିଟର କୋନିକାଲ୍ ଫ୍ଲାସ୍କରେ ସ୍କୁପ୍ କରାଯାଇଥିଲା ଏବଂ 15psi ଏବଂ 121 °C ତାପମାତ୍ରାରେ ଏକ ଘଣ୍ଟା ପାଇଁ ଅଟୋକ୍ଲେଭ୍ କରାଯାଇଥିଲା। ତା'ପରେ ଶସ୍ୟଗୁଡ଼ିକୁ ଏକ ସତେଜ କଲ୍ଚରରୁ ପ୍ରାୟ 5 ମିଲି ମାସେରେଟେଡ୍ ମାଇସେଲିଆ ସହିତ ଟୀକା ଦିଆଯାଇଥିଲା।ବି. କୁକେଇLSLP18 କୁ ପୃଥକ କରି ଘର ତାପମାତ୍ରାରେ 2 ସପ୍ତାହ ପାଇଁ ଛାଡି ଦିଆଯାଏ, ପ୍ରତି 3 ଦିନରେ ଫ୍ଲାସ୍କଗୁଡ଼ିକୁ ହଲାଇ ଦିଆଯାଏ। 2 ସପ୍ତାହ ପରେ, କବକ ସଂକ୍ରମିତ ଜ୍ୱାଳା ଶସ୍ୟକୁ ବାୟୁରେ ଶୁଖାଯାଏ ଏବଂ ତାପରେ 4 °C ରେ କ୍ଷେତ ଟୀକାକରଣ ପର୍ଯ୍ୟନ୍ତ ସଂରକ୍ଷଣ କରାଯାଏ। ସମଗ୍ର ପରୀକ୍ଷଣ ପାଇଁ ସମାନ ଟୀକାକରଣ ବ୍ୟବହାର କରାଯାଏ ଏବଂ ପ୍ରତିବର୍ଷ ତାଜା କରାଯାଏ। ଟୀକାକରଣ ପାଇଁ, 4-5 ସପ୍ତାହ ପୁରୁଣା ଜ୍ୱାଳା ଗଛର ହୁର୍ଲରେ 6-10 ସଂକ୍ରମିତ ଶସ୍ୟ ରଖାଯାଇଥିଲା। ଏହି କବକରୁ ଉତ୍ପାଦିତ ବୀଜାଣୁଗୁଡ଼ିକ ଗୋଟିଏ ସପ୍ତାହ ମଧ୍ୟରେ ଯୁବ ଜ୍ୱାଳା ଗଛରେ ସଂକ୍ରମଣ ଆରମ୍ଭ କରିଥିଲେ।

ବିହନ ପ୍ରସ୍ତୁତି

କ୍ଷେତରେ ଲଗାଇବା ପୂର୍ବରୁ ଜ୍ୱାଳା ବିହନକୁ ~ 1% ସ୍ପିରାଟୋ 480 FS କବକନାଶକ, 4% ସେବ୍ରିଂ 480 FS କବକନାଶକ, 3% ସୋରପ୍ରୋ 940 ES ବିହନ ସେଫନର ମିଶ୍ରଣ ସହିତ ଚିକିତ୍ସା କରାଯାଇଥିଲା। ତା'ପରେ ବିହନଗୁଡ଼ିକୁ 3 ଦିନ ପାଇଁ ବାୟୁରେ ଶୁଖାଯାଇଥିଲା ଯାହା ବିହନ ଚାରିପାଖରେ ଏହି ମିଶ୍ରଣର ଏକ ପତଳା ଆବରଣ ପ୍ରଦାନ କରିଥିଲା। ସେଫନର ପୂର୍ବ-ଉଦ୍ଭବ ଚିକିତ୍ସା ଭାବରେ ତୃଣନାଶକ ଡୁଆଲ୍ ମ୍ୟାଗନମ୍ ବ୍ୟବହାର କରିବାକୁ ଅନୁମତି ଦେଇଥିଲା।

ଲକ୍ଷ୍ୟ ପତ୍ର ଦାଗ ପ୍ରତିରୋଧର ମୂଲ୍ୟାଙ୍କନ

କ୍ଲେଟନ୍, ଏନସିର କେନ୍ଦ୍ରୀୟ ଫସଲ ଗବେଷଣା କେନ୍ଦ୍ରରେ ଜୁନ୍ ୧୪-୧୫ ୨୦୧୭ ଏବଂ ଜୁନ୍ ୨୦, ୨୦୧୮ରେ ପ୍ରତ୍ୟେକ କ୍ଷେତ୍ରରେ ଦୁଇଟି ପରୀକ୍ଷାମୂଳକ ପ୍ରତିକୃତି ସହିତ ଏକ ଅଦଳବଦଳ ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ବ୍ଲକ ଡିଜାଇନରେ SCP ରୋପଣ କରାଯାଇଥିଲା। ପ୍ରତି ପ୍ଲଟ୍ ପାଇଁ ୧୦ଟି ବିହନ ବ୍ୟବହାର କରି ୦.୯ ମିଟର ଧାଡି ପ୍ରସ୍ଥ ସହିତ ୧.୮ ମିଟର ଏକକ ଧାଡିରେ ପରୀକ୍ଷଣ କରାଯାଇଥିଲା। ଧାର ପ୍ରଭାବକୁ ରୋକିବା ପାଇଁ ପ୍ରତ୍ୟେକ ପରୀକ୍ଷଣର ପରିଧି ଚାରିପାଖରେ ଦୁଇଟି ସୀମା ଧାଡି ରୋପଣ କରାଯାଇଥିଲା। ପରୀକ୍ଷଣଗୁଡ଼ିକୁ ଜୁଲାଇ ୨୦, ୨୦୧୭ ଏବଂ ଜୁଲାଇ ୨୦, ୨୦୧୮ରେ ଟୀକାକରଣ କରାଯାଇଥିଲା ଯେଉଁଠାରେ ଜ୍ୱାଳା ଗଛଗୁଡ଼ିକ ବୃଦ୍ଧି ପର୍ଯ୍ୟାୟ ୩ରେ ଥିଲେ। ମୂଲ୍ୟାଙ୍କନ ଏକ ରୁ ନଅ ସ୍କେଲରେ ନିଆଯାଇଥିଲା, ଯେଉଁଠାରେ ରୋଗର କୌଣସି ଲକ୍ଷଣ ନ ଥିବା ଗଛଗୁଡ଼ିକୁ ନଅ ଭାବରେ ସ୍କୋର କରାଯାଇଥିଲା ଏବଂ ସମ୍ପୂର୍ଣ୍ଣ ମୃତ ଗଛଗୁଡ଼ିକୁ ଗୋଟିଏ ଭାବରେ ସ୍କୋର କରାଯାଇଥିଲା। ୨୦୧୭ରେ ଦୁଇଟି ମୂଲ୍ୟାଙ୍କନ ଏବଂ ୨୦୧୮ରେ ପ୍ରତିବର୍ଷ ଟୀକାକରଣର ଦୁଇ ସପ୍ତାହ ପରେ ଚାରିଟି ପାଠ୍ୟକରଣ ନିଆଯାଇଥିଲା। sAUDPC (ରୋଗ ପ୍ରଗତି ବକ୍ର ଅଧୀନରେ ମାନକୀକରଣ କ୍ଷେତ୍ର) ପୂର୍ବ ବର୍ଣ୍ଣିତ ଅନୁସାରେ ଗଣନା କରାଯାଇଥିଲା।


ପୋଷ୍ଟ ସମୟ: ଏପ୍ରିଲ-୦୧-୨୦୨୧